Les objectifs statutaires, définis avec prévoyance par le fondateur lui-même, sont l'étude et la diffusion de la musique contemporaine, en particulier en ce qui concerne les activités musicales, littéraires et artistiques de Giacinto Scelsi, ainsi que toute autre activité littéraire, culturelle et d'exposition en Italie et à l'étranger, la recherche, l'étude et la diffusion de la musique ésotérique, de toute origine et époque.
La Fondation Isabella Scelsi poursuit ses objectifs statutaires à travers une activité articulée devenue particulièrement dynamique depuis 2004, développée dans des domaines différents et étroitement liés :
- soirées et rendezvous musicaux (Musée)
- ateliers, séminaires, conférences, masterclasses (Musée et Archives)
- conservation et mise en valeur du patrimoine artistique et culturel de Giacinto Scelsi (Archives)
- recherche scientifique
- bourses d’étude
- conférences d'études internationales
- publications dans des magazines, monographies, livres divers, actes de conférences, etc.
- édition des partitions de l'examen critique
- éditions records
- conseils scientifiques pour des activités musicales, scientifiques et éditoriales promues par d'autres institutions.